确诊必须依靠胃镜检查及胃粘膜活组织病理学检查 。
鉴别诊断
有消化不良症状者需与以下疾病鉴别：
1胃癌
2消化性溃疡
3慢性胆囊炎和胆石症
4慢性肝病
5慢性胰腺炎
1胃癌 临床表现多无特异性，如食欲减退、恶心呕吐、上腹部不适等，晚期可有贫血、上腹包块、体重减轻 。早期的胃镜和活检、超声内镜、 X 线钡餐检查等有助于鉴别诊断 。
2消化性溃疡 均有消化不良症状，但溃疡病以上腹部节律性、周期性疼痛发作为主，而慢性胃炎的上腹痛大多无节律性，且以消化不良症状为主 。两者的鉴别诊断主要依靠 X线钡餐检查、胃镜和活检 。
3胆囊炎、 胆石症 症状多不典型，患者可有慢性右上腹不适或疼痛、上腹饱胀等消化不良症状 。但既往有胆绞痛病史，摄入油腻饮食可引发典型胆绞痛发作 。B 超、ERCP，MRCP等有助鉴别 。
4慢性肝炎、肝癌、慢性胰腺疾病 可因食欲不振、消化不良症状为主述，但通过详细地询问病史、体格检查以及相关的实验室和影像学检查可与慢性胃炎鉴别 。
5功能性消化不良(functional dyspepsia，FD) FD是指一组病因未明的、 排除了器质性疾病的包括溃疡样、 反流样、 动力障碍样或混合型消化不良征候群，其病程持续 4周以上 。胃排空测定、 腔内压测定、胃电图等检查，如发现胃排空延缓或胃电节律紊乱等，有助于FD诊断 。

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