借助高通量基因组测序仪 , 科学家们实现了 DNA 片段的序列测定 。 接下来就需要定位 DNA 片段在基因组上的位置:以何种挨次位于哪些染色体上 。
为此 , 哈佛年夜学的 Alison Cloutier 和其他当作员阐发了数百万个 DNA 片段中近 9 亿个核苷酸 , 并经由过程与鸸鹋的基因组相对照以定位 DNA 片段的位置 。 这是因为鸟类基因组 , 包罗其他八种(都已灭尽)恐鸟 , 都具有相似的布局 。 也就是说 , 节制特定性状的基因倾标的目的于位于不异的染色体上 , 分歧基因的摆列体例也相似 。

图 | 小灌木恐鸟与几种近亲鸟类基因组对比
事实上 , 这种经由过程近亲对比的方式已被普遍用于古基因研究 。 例如 Shapiro 和她的研究小组操纵带状鸽的基因组来重组侯鸽短 DNA 片段的序列 。 今朝 , 她也正在尽力为渡渡鸟做近似的工作:用尼科巴鸽子(与渡渡鸟血缘关系比来的物种)的基因组作为模板 。
再如 , 哈佛年夜学的 George Church 团队正在对年夜象染色体进行测序 , 用于猛犸 DNA 重组的参考 。 此外按照研究 , 猛犸的灭尽与疱疹病毒传染有关 。 是以 , Church 团队打算在重组基因组之前 , 先用基因工程导入疱疹病毒抗性基因 。 Church 暗示 , 本年他们将颁布发表研究进展 。

图丨Ben Mezrich讲述全宿世界规模内新生猛犸象的新著《长毛象:新生史上最具标记性的灭尽生物的真实故事》(Woolly: The True Story Of The Quest To Revive One Of History’s Most Iconic Extinct Species)
在此次的研究中 , 哈佛年夜学的科学家们恢复了恐鸟年夜约 85% 的基因组 。
“另 15% 很难经由过程鸸鹋的基因组恢复 。 ”Novak 说 , “要将细小的片段拼接当作完整的基因组很是坚苦 。 ”普林斯顿年夜学博士后 Charlie Feigin 也暗示了不异的观点:“你可以从近亲物种上寻找线索 , 但这不克不及包管能获得完整且准确的灭尽物种基因组 。 ”

图丨George Church与“猛犸象”对望
鉴于此 , 尽管科学家将组装后的灭尽物种基因组注入活体物种的卵子后 , 能重现这种灭尽物种 , 可是它可能不会是原始物种的完美复成品 。 举个例子 , 与原始侯鸽比拟 , 如许获得的侯鸽可能以不异食物为食 , 但有着分歧的生殖和社会行为 。
并且 , 在鸟类卵子中实现基因组导入其实比在哺乳动物中更坚苦 。 众所周知 , 哺乳动物的基因可以经由过程克隆手艺重组到哺乳动物卵细胞中 , 这也就是最初颤动一时的“多利羊手艺” 。
“但至少今朝为止 , 这在野生鸟类中并不合用 。 ”Brand 说 。 独一一个变通方式是将基因组转化导入到能分化当作卵子或精子的胚胎细胞中 , 这种方式比来在家鸡中取得当作功 。

事实上 , 重组绝迹基因组在这个范畴并不罕有 。 按照 Novak:“正式报道已有四五种绝迹基因组重组研究 , 但现实上正在进行绝迹基因组重组的研究数目可能是颁发数目的四倍 。 ”
此中 , 接近实现基因组重组的物种包罗猛犸象 , 侯鸽和两种已灭尽的前人类 , 尼安德特人和丹尼索瓦人 。 别的 , 在还处于“基因组石器时代”的 1984 年 , 就实现了斑驴的 DNA 测序 , 这是第一个实现 DNA 测序的绝迹物种 , 但它不合适现代尺度 。
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